Ученые разработали новый метод для изучения взаимодействия между белками и РНК в живых клетках. Этот подход, названный APEX-TRIBE, объединяет две существующие технологии: APEX2 для мечения белков и TRIBE для идентификации РНК-мишеней.
Метод APEX-TRIBE позволяет исследователям наблюдать за взаимодействиями белок-РНК в реальном времени, что особенно важно для понимания динамических процессов в клетке. Он обеспечивает высокое пространственное и временное разрешение, что дает возможность изучать эти взаимодействия в конкретных клеточных компартментах и в определенные моменты времени.
Исследователи продемонстрировали эффективность APEX-TRIBE на примере белка FUS, который играет важную роль в различных нейродегенеративных заболеваниях. Они смогли идентифицировать РНК-мишени FUS в цитоплазме и ядре клетки, а также обнаружили, что мутантная форма FUS связывается с другим набором РНК по сравнению с нормальным белком.
Этот метод открывает новые возможности для изучения роли взаимодействий белок-РНК в различных биологических процессах и заболеваниях. Он может помочь в разработке новых терапевтических подходов, основанных на понимании этих взаимодействий.
APEX-TRIBE имеет ряд преимуществ перед существующими методами. Он позволяет изучать взаимодействия в живых клетках, не требует сложной пробоподготовки и может быть применен к различным белкам и типам клеток.
Источник: nature.com
