В 1917 году после отречения Николая II от престола его семья оказалась под охраной и была вывезена в Екатеринбург. В июле 1918 года император, императрица, их пятеро детей, врач и трое сотрудников семьи были расстреляны в Ипатьевском доме. Тела тайно захоронили, обработали серной кислотой и на долгие годы скрыли место захоронения.
В 1991 году недалеко от Екатеринбурга обнаружили братскую могилу с останками девяти человек. Судебные эксперты установили, что среди погибших были четыре мужчины и пять женщин, а характер повреждений указывал на насильственную смерть. По строению костей, возрасту, полу и особенностям дорогих стоматологических работ предположили, что останки принадлежат членам императорской семьи и их окружению.
Для проверки этой версии британские и российские специалисты применили генетические методы. Анализ ДНК выявил семейную группу из двух родителей и троих детей, а также четырех посторонних людей. Митохондриальная ДНК останков императрицы и ее дочерей совпала с образцом, предоставленным принцем Филиппом, родственником Александры по женской линии.
У Николая II обнаружили особенность митохондриальной ДНК, получившую название гетероплазмии. Чтобы окончательно подтвердить родство, в 1996 году эксгумировали останки его брата Георгия, умершего в 1899 году, и нашли у него такую же генетическую особенность. Расчеты показали, что полученные данные в 130 миллионов раз вероятнее при принадлежности останков семье Романовых, чем неродственной семье.
На тот момент не хватало останков двоих детей Николая II, что породило версии об их спасении и поддержало историю женщины, называвшей себя Анастасией. В 2007 году примерно в 70 метрах от первой могилы нашли останки девушки 15–19 лет и юноши 12–15 лет. Исследование митохондриальной и Y-хромосомной ДНК подтвердило, что они были братом и сестрой, родственниками уже идентифицированных Романовых, а найденный юноша соответствовал мужской линии императорской семьи, сообщает Live Science.