Российские специалисты провели масштабное исследование сайтов связывания факторов транскрипции, которые играют ключевую роль в регуляции активности генов. Факторы транскрипции представляют собой специальные белки, контролирующие процесс синтеза мРНК на матрице ДНК путем связывания со специфическими участками ДНК.
Ученые использовали современный метод ChIP-seq, который позволяет исследовать профили связывания различных транскрипционных факторов в масштабе всего генома. Этот метод дает возможность получить точную картину распределения сайтов связывания без предварительной селекции исследуемых районов.
Сайты связывания представляют собой короткие сегменты ДНК длиной от 8 до 20 пар оснований, обладающие высоким сродством к факторам транскрипции. Взаимодействие осуществляется за счет электростатических сил, водородных связей и сил Ван-дер-Ваальса.
Большинство транскрипционных факторов не работают в одиночку — для активации транскрипции гена с его регуляторными элементами должно связаться большое количество факторов. Это приводит к привлечению промежуточных белков и сборке преинициационного комплекса.
Созданный каталог имеет большое значение для медицины, поскольку изменения в сайтах связывания часто ассоциированы с различными заболеваниями. База данных поможет лучше понять механизмы работы генома и развития патологических состояний, сообщает Российский научный фонд.
